Bioénergétique

[Thomas Bouyoux]

Salut
Je ne peux pas trop répondre à ta question, le prof n'explique pas vraiment pourquoi, je crois qu'il y a une histoire avec les charges négatives et les forces de répulsion mais je ne peux pas détailler énormément. Ne t'embête pas avec ce genre d'interrogations, retiens juste que grâce à la résonance et à la tautomérie céto-énol que la variation d'énergie libre est encore plus exergonique

[Soshy04]

Salut
Je comprends pas comment les concentrations relatives d'ATP, d'ADP et de phosphate inorganique peuvent modifier la variation d'énergie libre de l'hydrolyse d'UNE liaison B gamma de l'ATP ?

[FIT]

Bonjour,

Je me pose deux questions à propos du cycle de Krebs à savoir, dans la première étape (la condensation de l’acetyl CoA) la citrate synthase agit elle sur les deux étapes de cette condensation cad lorsque l’acetyl CoA et l’oxaloacetate forme le citroyl CoA et/ou aussi lorsque la citrate est formée à partir du citroyl CoA ? Et la même chose pour la 5eme étape du cycle (formation du succinate) qui se déroule en trois étapes, la succinyl CoA synthétase agit elle sur les 3 étapes ou deux ou une ? En fait est ce que l’enzyme agit sur toutes les étapes intermédiaires d’une réaction ?

En plus de cela, lorsque l’on dit que la réaction est réversible les étapes intermédiaires sont elles toutes réversibles ?

Merci d’avance.

[Thomas Bouyoux]

[quote="FIT"]
Bonjour,

Je me pose deux questions à propos du cycle de Krebs à savoir, dans la première étape (la condensation de l’acetyl CoA) la citrate synthase agit elle sur les deux étapes de cette condensation cad lorsque l’acetyl CoA et l’oxaloacetate forme le citroyl CoA et/ou aussi lorsque la citrate est formée à partir du citroyl CoA ? Et la même chose pour la 5eme étape du cycle (formation du succinate) qui se déroule en trois étapes, la succinyl CoA synthétase agit elle sur les 3 étapes ou deux ou une ? En fait est ce que l’enzyme agit sur toutes les étapes intermédiaires d’une réaction ?

En plus de cela, lorsque l’on dit que la réaction est réversible les étapes intermédiaires sont elles toutes réversibles ?

Merci d’avance.
[/quote]
Salut
La citrate synthase agit dans les 2 étapes de la réaction. L'oxaloacétate va provoquer un changement de conformation de l'enzyme qui va pouvoir fixer le 2nd substrat qui est l'acétyl CoA. Une fois les 2 substrats fixés, ils vont donner l'intermédiaire (le citroyl CoA) qui provoque à nouveau un changement de conformation de l'enzyme qui va pouvoir hydrolyser la liaison thio-ester pour donner du citrate
Pour la 5ème étape, l'enzyme participe également aux 3 étapes de la réaction qui mène à la production de GTP. Cependant j'avais compris de mes cours qu'en fait c'est la réaction qui produit de l'ATP à partir du GTP qui est réversible. C'est cette partie dont on parle quand on dit que l'étape 5 est réversible car la variation d'énergie libre est nulle lors du passage GTP-GDP --> ADP-ATP

[Soshy04]

Bonjour,
Je comprends pas cette phrase pour la 1ère réaction du cycle de krebs : "la variation d'énergie fortement négative est nécessaire au bon fonctionnement du cycle. En effet, les concentrations d'oxaloacétate normalement présentes sont très faibles"
Je comprends pas le rapport

[Thomas Bouyoux]

[quote="Soshy04"]
Bonjour,

Je comprends pas cette phrase pour la 1ère réaction du cycle de krebs : "la variation d'énergie fortement négative est nécessaire au bon fonctionnement du cycle. En effet, les concentrations d'oxaloacétate normalement présentes sont très faibles"

Je comprends pas le rapport
[/quote]
 
Pour moi l'oxaloacétate est en faible quantité car il est constamment utilisé par la réaction catalysée par la citrate synthase qui est très exergonique. Il faut donc que la variation d'énergie libre soit négative au niveau du cycle pour qu'il y est production d'oxaloacétate car sinon il ne serait pas produit vu que la réaction amenant à sa formation ne se fait pas dans son sens dans les conditions standards mais dans le sens du L-malate

[Thomas Bouyoux]

Il est soluble mais associé à la membrane interne mitochondriale
Petit lien entre l'UE1 et l'UE2 puisque tu le vois en biologie cellulaire